אמצעי הליבה של מסנן מתלכד הוא בדרך כלל מיקרופייבר זכוכית עדין- במיוחד או סיבי פוליאסטר שעברו טיפול כימי מיוחד. חומר זה חייב להיות בעל הידרופיליות מצוינת (להסרת מים) או אולאופיליות (להסרת שמן) כך שטיפות מיקרוסקופיות יכולות להיצמד במהירות ולהתלכד. בנוסף, המדיה חייבת להיות בעלת חוזק מבני מספיק כדי לעמוד בלחץ ההפרש הגבוה והשפעת הנוזל במהלך תהליך הסינון.
